《数码宝贝大冒险：最后的进化·羁绊》画面开始来到东京，天空中出现了极光，之后就转到数码宝贝出现在人类世界，太一、嘉儿、阿武先后前往支援。然后前半段高潮就来了，没错就是亚古兽进化！这个进化画面超燃，完全跟第一季相同，击败了《数码宝贝大冒险tri》每一集的进化片段，这段出来加上音乐次元君就流泪了，但进化的画面只有到完全体的片段。

之后一位神秘少女出现、也就是预告出来的那位（中文要怎么翻我还真的不太知道、就以神秘少女代替吧）。因为世界各地出现被选召的孩子，陆陆续续不明的失去意识，为了调查此事而把太一他们找来，为了阻止这一切的源头“艾尔斯兽”（PS：自己乱取的）。

太一、阿和、光子郎、阿武等人进入网路世界准备击败他，在此期间奥米加兽驾临，眼看就要打倒敌人，但奥米加兽突然解除了合体，而艾尔斯兽就这样逃走了。

回到现实世界的太一等人，在想为什么会解除合体？难道又跟《数码宝贝大冒险tri》一样？ 其实不然，原因是太一和阿和的数码伙伴时间要结束了，如果做了无谓的进化，战斗结束的时间也就越快，难道长大成人就一定要跟数码伙伴分开吗？

为了调查艾尔斯兽的行踪，光子郎开始了全面搜索，而阿和也觉得有些异常，所以拜托了第二季的大辅等人帮忙调查，但到最后才知道眞正的源头其实是那位神秘少女，艾尔斯兽只是她创造出来的人工数码宝贝罢了。当太一和阿和正在犹豫要不要应战时，亚古兽和加布兽说：“战斗吧！为了救出大家。”

奥米加兽再次登场，但即便奥米加兽是皇家骑士的一员，却仍然打不过已和神秘少女结合的究极体艾尔斯兽，关键时刻这时太一吹起了嘉儿的哨子，「本文内容由趣果弥音吧（www.qgmy8.com）原创撰写，未经许可谢绝转载」哨音唤醒了失去意识的光子郎等人。随着太一跟阿和神圣企划的时间倒数，也来到了这次的主题“最终进化”、进化前说他们说到：“就算这是最后一次，我也想和你一起战斗”,“这就是我们最后的进化！”就这样亚古兽和加布兽进化成了新型态的人形数码宝贝并救出了神秘少女。

大家应该很疑惑这神秘少女是为什么要这么做，次元君中间跳了很多，大概来说一下：在神秘少女14岁前也有数码宝贝“蝴蝶兽”，但随着少女的成长，她渐渐的不需要数码宝贝的帮忙，在14岁时就和蝴蝶兽结束了伙伴关系（结束伙伴关系的话数码宝贝也会被删除数据）。因为这样的经历，她创造了一个网路空间，这里可以保存每个被选召孩子的记忆，孩子们的意识也就此被夺取。

剧情来到了最后，太一和亚古兽在台场海滨旁，阿和和加布兽在某个大楼看风景，而大和则吹起了很久没拿出来的口琴。亚古兽说想吃冰，太一说“你最喜欢的是哈密瓜口味对吧？”亚古兽回答：“太一，你真的长大了呢~”另一边加布兽对阿和说到：“能跟阿和成为伙伴是我最骄傲的事情！”

“我们明天要做什么呢？”亚古兽和加布兽一起问道，当太一和阿和准备回答时，亚古兽和加布兽已经消失，神圣企划的倒数时间石化，太一和阿和也嚎啕大哭了起来

最后太一和阿和都向着自己的目标前进然后说到：“等着喔！总有一天一定会再去见你们的！”故事到此结束。《数码宝贝大冒险：最后的进化·羁绊》真心推荐给喜欢数码宝贝的小伙伴，有很多片段都让次元君潸然泪下，大概是因为里面有我们的青春吧！